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动物基因组DNA的提取

来源:通派(上海)生物科技有限公司   2015年12月29日 13:13  

动物基因组DNA的提取

实验步骤:
  在无液氮的条件下,铡备鼠肝DNA,与有液氮条件下相比,产量和质量都有所下降。整个操作过程中,应尽量避免DNA酶的污染,特g4注童动作温和,减少对DNA的机械捌伤。
1、取0.2g鼠肝,用冰冷的生理盐水洗3次,然后置于2.0mL匀浆掖中,用玻璃匀浆器匀浆至无明显组织块存在(冰浴操作,切匆将细胞破碎,可镜检观察)。

人胚胎心脏成纤维样细胞HEH2
人结直肠腺癌细胞HCT 116  
人结直肠腺癌细胞LoVo  
人胰腺腺泡上皮癌HPAC  
人结直肠腺癌细胞SW620  
人胰腺癌细胞AsPC-1  
人胃癌细胞MKN-45  
人胃腺癌细胞SGC-7901  
2、将组织细胞移至1.5ml离心管中,50000rpm离心30-60sec,(尽可能在低温下操作),弃上清,若沉淀中血细胞较多,可再加入1倍于细胞体积的匀浆液洗一次。
3、沉淀加0.8mL无菌水迅速吹散,分两管,再加0.4mL酵解液,翻转混匀(动作一定要轻)55℃水浴处理12-18 h;
4、沉淀加RNase至终浓度200µg/mL,37℃水浴1 h;
5、加入等体积酚/氯仿/异戊醇抽提一次,(慢慢旋转混勾,倾斜使两相接触面增大)。4℃、10min、10000rpm离心;
6、有时如果DNA含量过高,水相在下层,实验时应注意观察。用扩口吸头移出含DNA的水相(注意勿吸出界面中蛋白沉淀),加等体积氧仿/异戊醇,4℃、
10 000rrpm离心10rain (若界面或水相中蛋白含量多,可重复1.6操作)。
7、用扩口吸头小心吸出上层含DNA的水相,加1/10体积的NaAc,小心混匀(要充分),再向每管中加入2.5倍体积的无水乙醇,-20夜。
8、12 000rpm离心19min,弃上清,75%冷乙醇洗涤一次,12000rpm离心15min室握温干燥(不要大干,否则DNA不易溶解),加入适量TE缓冲液,存放于4℃,轻摇溶解夜,即可得 到实验动物基因组DNA。

人小细胞肺癌细胞DMS 153  
人胚肺细胞 VA13细胞WI-38 VA13亚系 2RA  
人胚肺二倍体细胞HEL-1  
人胚肺细胞系KuMA  
人肺转化细胞系AE1201    
人肺鳞癌细胞NCI-H226  
人胚肺二倍体细胞HEL-2  
9、电泳鉴定DNA,由于基因组DNA相对分子质量较大,用0.3%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,先在底部锦一层1%的支持胶,凝固后再铺上一层0.3%琼脂糖凝胶,插上梳子(枚子不能瑾到的支持胶)。取1.5µL溶解的DNA、1µL上样缓冲液和35µl无菌水混匀后小心上样(可在另一孔加DNA相对分于质量标准),观察基因组DNA大小,用溴化乙锭染色观察结果。

注意事项:
1、操作过程尽量在低温下进行,避免DNA降解。
2、琼脂糖凝胶脆弱,应小心操作。
3、提取得到的基因组DNA应为单一条带,DNA降解可形成弥散带型。

人胚肺成纤维细胞MRC-5  
人胚肺成纤维细胞CCC-HPF-1  
人胚胎气管组织来源细胞CCC-HBE-2  
人胚胎肺成纤维细胞WI-38  
SV-40Z转化肺成纤维细胞WI38/VA13  
人胚肺二倍体细胞2BS  
人胚肺二倍体细胞KMB-17  
人肺细胞HLF-a  
人支气管上皮样细胞BEAS-2B  
人胚肺转化细胞SL-1  
人肺腺癌细胞Calu-3  
人小细胞肺癌细胞NCI-H209  
人低分化肺腺癌细胞GLC-82  
人小细胞肺癌细胞NCI-H446  
人非小细胞肺腺癌细胞NCI-H157  
人肺鳞癌细胞NCI-H520  
人肺巨细胞癌高转移细胞株PG-BE1  
人肺巨细胞癌低转移细胞株PG-LH7  
人肺癌细胞A-427  
人低分化肺腺癌细胞SK-LU-1  
人肺支气管癌细胞NCI-H1650  
人非小细胞肺腺癌细胞NCI-H1975  
人非小细胞肺腺癌细胞NCI-H2087  
人小细胞肺癌细胞NCI-H2227  
人非小细胞肺癌细胞NCI-H23  
人胚胎心肌组织来源CCC-HEH-2  
人脐静脉内皮细胞HUV-EC-C  
人脐静脉内皮细胞(人膀胱癌细胞污染)ECV-304  
血管平滑肌细胞T/G HA-VSMC  
人胰腺导管癌细胞CFPAC-1  
人食管癌细胞EC109  
人食管癌细胞NEC  
人结肠腺癌细胞LS 180  
人结直肠腺癌瘤株HCT 116  
人结直肠腺癌细胞COLO 201 

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