洁净室的污染源有：
a、人是洁净室大的污染源
规范进入洁净室内人员的着装和洁净室内人员的行为动作以控制人员的产尘。
b、周围环境的污染空气的渗入
加强维护结构的密封、堵漏，维持洁净室的正压。
c、未经HEPA过滤的空气的送入
对送入洁净室的空气要全部经过三级过滤，终端是HEPA过滤，安装过滤器要密封、检漏、堵漏。维持洁净室内的正压。
d、围护结构的产尘和其他表面的产尘
对围护的表面、顶、墙、地以及其他表面要定期擦拭、消毒和清扫。
e、工艺设备和工艺过程的产尘
对工艺的产尘要进行局部处理，避免污染扩散到全室。加强局部围挡和局部排风等。
f、原材料、容器、水、气、溶剂以及外包装的产尘
外包装不应在洁净室内拆除。容器要进行消毒清洗处理，原材料要溯源到原材料的生产、供应、包装等情况。控制原材料、水、气和溶剂的净化来控制其带来的污染。
g、在自然界和人们生活环境中存在有大量的微生物。例如；每克土壤中存在有104~1010个微生物，每克水中存在有101~104个微生物，每克空气中存在有104~106个微生物，每平方厘米人的皮肤中存在有101~104个微生物，每平方厘米的地板中存在有104~107个微生物，而且微生物又是一种耐寒，耐热，抗辐射，抗紫外线照射，抗药能力很强的污染物。热原是微生物的代谢物，是一种难以去除的污染。热原的穿透力很强，能穿透过滤器的滤料；热原又能耐150度的高温，灭菌难以杀灭热原。