在上世纪的90年代早期，发现了MeCP2蛋白，并提出它是作为下游基因的抑制蛋白来发挥功能。自那时起，研究人员将大部分的精力都集中放在鉴别这些基因上，希望它们有可能成为药物开发的靶点。然而过去15年来来自诸多实验室的研究结果生成了一份长长的基因清单，它们之间几无重叠，使得研究人员对于MeCP2突变导致神经功能障碍的机制难以达成共识。

    研究人员在探讨一个共同的课题时着手分析了各种基因表达数据集。这使得他们获得了一个有趣的研究发现：在Rett综合征中遭到破坏的基因都非常的长。基因的平均大小约为2万个核苷酸，大约10%的基因长于10万个核苷酸，一些长度超过了100万个核苷酸。长度在10万个核苷酸以上的基因在Rett综合征中受影响严重。

    我们所有的细胞都具有相同的基因。肝细胞与心脏细胞、脑细胞的不同之处在于，一些特殊基因的沉默或是激活以及激活（表达）的程度。

    研究人员在所有分析的数据集，以及对不同小鼠大脑区域的研究中发现，在缺乏MECP2的情况下一些长基因的表达升高。此外，他们发现基因的长度越长，基因表达就越是升高。尽管表达增高幅度并不太大——只有3-10%，——加诸于成千上万的基因由此有可能对大脑功能造成了显著的影响。

    研究人员还发现，长基因表达增高的程度与疾病的严重度相关：Rett样症状越是严重的小鼠显示越高程度的过表达。后，他们检测了罹患Rett综合征的个体尸解大脑中的基因表达。如小鼠模型中一样，他们发现了一些长基因过表达。长基因表达遭到破坏似乎是Rett综合征和相关疾病一个*的标志。当我们分析与Rett综合征没有相似之处的其他神经系统疾病的基因表达数据时，我们没有看到对极长基因的相同效应。

    数据表明了，Rett综合征有可能是由于功能上对于大脑极为重要的一些长基因相对细微而广泛的过表达所导致，而重复综合征可能是由于相同的这些基因低表达引起。

    有趣的是，我们发现尽管机体所有的细胞都利用短长度和中等长度的基因，相比于机体其他部位长基因在大脑中更多的表达。这一事实可以帮助解释为何Rett综合征主要是一种神经系统疾病。